引起慢性鼻窦炎的病因主要分为以下几类，往往多种因素并存。

一、感染因素

微生物感染是形成慢性鼻窦炎的直接原因。其致病菌主要为化脓性球菌，亦有杆菌和厌氧菌，以及真菌感染，多为混合感染。感染的来源主要有：

1、急性鼻窦炎未彻底治愈，病程迁延，这是最主要的。

2、邻近器官病变影响：如慢性扁桃体炎、小儿腺样体炎，可致鼻腔长期受阻，引起鼻窦炎;由于上颌窦与长在长颌骨的牙齿相邻，若有虫牙(龋齿)，引起牙根部感染，有可能引起上颌窦炎的急性或慢性炎症。

3、其他原因：游泳时水入鼻腔，进入鼻窦，细菌随之进入，可以引起鼻窦炎;坐飞机时，在飞机起飞或下降过程中，对于原有鼻腔疾病的患者来说，由于气压的改变，细菌有可能进入鼻窦，引起鼻窦炎，等等。

二、鼻腔与鼻窦引流不畅

1、鼻息肉、鼻中隔过度偏曲，使鼻腔不通畅，鼻窦开口处受阻，引起鼻窦内的炎症。

2、变态反应性鼻炎、慢性鼻炎等病变时，鼻腔粘膜长期慢性充血，鼻窦开口处受阻，可进一步引起慢性鼻窦炎。

3、鼻腔内长期存在异物，或鼻部手术后堵塞物久滞，阻塞鼻窦开口，导致鼻窦炎。

三、免疫功能不足

1、鼻黏膜局部免疫功能障碍：由于环境污染，鼻腔用药不当(长期使用某些滴鼻药、吹药入鼻、长期洗鼻，等)，治疗不当(鼻甲微波、激光、部分切除、经常性化学烧灼等)，造成鼻腔与鼻窦黏膜上皮的纤毛功能(其功能为将有毒有害物质向后排送而吐出)减退、局部免疫功能不足(鼻黏膜所分泌的黏液中，具有丰富的免疫活性物质，如多种免疫球蛋白、溶菌霉、干扰素等)等，可能是慢性鼻窦炎的因素之一。

2、身体素质差，免疫功能低下，变态反应性体质，容易感受上呼吸道感染，引起鼻窦内细菌感染或真菌感染长期存在，并与变态反应性有一定关系，从而形成慢性鼻窦炎。

3、全身性慢性疾病，以及嗜好烟酒过度，导致机体免疫功能低下，容易产生慢性鼻窦炎。

4、支气管扩张，其中先天性支气管扩张与慢性鼻窦炎同时发生，可能与染色体遗传病有关;后天性支气管扩张亦常与慢性鼻窦炎同时存在，机理不明。