支原体引起子宫癌(支原体会引起子宫癌吗)支原体引起子宫癌(支原体会引起子宫癌吗)

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支原体引起子宫癌(支原体会引起子宫癌吗)

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支原体污染是细胞培养中普遍存在的一种臭名昭著的污染源。支原体的存在会剥夺细胞的营养物质,改变某些基因的表达水平,从而对细胞生物学的研究产生深远的影响。支原体是最小的可体外生长的微生物,直径约为0.3~0.8um,它们可以通过滤菌器而无法被过滤出去。又因为其缺乏细胞壁,所以常规的抗生素并不能对它们起到抵抗作用。由于支原体本身的特性,不易被清除,而导致实验研究中资金和人力的极大损失。

Mycoplasma (orange) can surround and infect cells and invalidate results of gene-expression studies.

宾西法尼大学的研究者John Hogenesch和Anthony Olarerin-George发现,支原体污染远比我们想象的更加严重和普遍,这篇新闻《支原体毁了多少细胞研究》发表在2014年7月29日的《Nature》,再次引发了细胞学科研工作者对于支原体污染的关注。(原文地址:http://www.nature.com/news/contamination-hits-cell-work-1.15632)

John Hogenesch每次看到自己的实验员愁眉不展时,他立马就知道是实验出问题了,他会给与实验员一个好的方法去查找失败的原因——“检查下细胞培养是否存在支原体污染”。

支原体污染总是会影响研究的发现,并浪费大量的科研经费。John Hogenesch的实验室去年就遭遇了一次支原体污染,虽然很快解决了问题,但还是损失了大约100,000美元和一年的研究时间。支原体污染除了来源于其他污染的细胞外,大多数是来自于实验室操作人员,很多支原体在人体是正常菌群,稍有不慎就可能带入实验室而污染细胞。支原体再生很快,它不像其他的微生物会使得培养基变得浑浊,它的存在不会产生任何可视的特征。

支原体是一个长期存在的问题。1956年,约翰霍普金斯的研究者报道了其实验室中的Hela细胞存在支原体污染,而Hela细胞作为一种人宫颈癌细胞被广泛地用于各个研究领域。20世纪90年代初,美国食品和药物管理局检测了超过20,000例细胞培养,结果发现超过15%的细胞培养存在支原体污染。1991年,阿根廷的一项研究表明,200个细胞样本中污染了支原体的细胞超过70%。特别是最近,2002年来自德国DSMZ(国家菌种保藏中心)的研究表明,440种细胞系(大多是白血病淋巴瘤细胞)中存在28%的比例被支原体污染。以上研究数据表明支原体存在已久,并且持续存在不容忽视。

为了全面地了解支原体污染的情况,获得公平的评估数据,John Hogenesch和Anthony Olarerin-George进行了广泛的样本分析,他们分析的样本序列数据来自于NCBI的高通量测序数据库(SRA)中的项目,主要是2012年-2013年进行的实验项目,包括啮齿类动物样本和灵长类动物样本共计9395种。通过对这些样本细胞进行基因表达水平的研究,寻找支原体DNA,结果发现11%的样本都存在有支原体污染。

Hogenesch告诉我们,样本分析中,支原体存在水平较高的研究项目的成果还曾见刊于一些领先的杂志,包括细胞(Cell)、自然(Nature)和美国科学院院报(Proceedings of the National Academy of Sciences)等。虽然支原体污染的存在并不能说明这些研究发现是无效,但是这种细菌却可以影响数百个基因的表达水平,并且通过与细胞竞争营养物质而阻碍细胞的生长。此外,在一组感染了支原体的淋巴瘤细胞中,Hogenesch和Olarerin-George发现并鉴定了61个被支原体所改变的基因。目前,这些工作的可以在 BioRxiv 生物预印本网站上看到,并且他们计划很快将他们的发现提交给同行评审期刊。Hogenesch说,如果查过十分之一的细胞被污染的话,重复实验和更换细胞所花费的时间和资源将会导致数亿美元的损失。

Hans Drexler,来自德国菌种保藏中心的临床科学家认为,支原体污染是“草率操作”的结果,支原体是不会凭空出现的,它们都是被人带入细胞培养中。对于如此多的细胞存在污染,他并不感到惊讶。在2010-2013年间他的实验室收到的人急性白血病和淋巴瘤细胞中约有10%存在有支原体污染,相比较于20世纪90年代初的感染率25%来说已经算是一种进步。

Drexler认为,支原体的持续存在是由于细胞研究中的“黑市交易”,研究者们总是随意地共享细胞培养液。他估计通过这种来源获得的细胞中10%的存在支原体污染,而官方供应商提供的细胞则不存在支原体污染。为了解决这个问题,Drexler建议实验室可以多花些钱从信誉良好的销售渠道那购买细胞系,并且对已有的细胞系进行支原体的检测。

目前,对于支原体污染的检测,我们可以用先达基因(http://www.gendx.cn)推出的支原体检测试剂盒,每次检测只需半个小时,减少了很多工作量,其原理是基于其自主研发的恒温核酸检测技术(ERA),结合恒温荧光定量检测仪,可以在恒定的低温下(25℃-42℃)对痕量的支原体种内保守性DNA片段进行特异性的扩增,扩增反应可以在20min内完成,该试剂盒检测范围涵盖130种支原体。



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