人类的嘴唇是在胚胎早期发育时，由两侧组织渐渐往身体中线连结起来的，而当胚胎无法按照预定的进度达成连结时，就会产生各种不同的裂缝，象是唇裂、颚裂与唇颚裂。

唇腭裂目前还没有统一的分类方法，但 根据硬腭和软腭部的骨质、黏膜、肌层的裂开程度及部位，多采用以下临床方法进行分类：

(1)软腭裂：仅软腭裂开，有时只限于腭垂，不分左右，一般不伴唇裂，临床上以女性比较多见。

(2)不完全性腭裂：亦称部分腭裂，软腭完全裂开伴部分硬腭裂;有时伴发单侧不完全唇裂，但牙槽突常完整，本型也无左右之分。

(3)单侧完全性腭裂：裂隙自腭垂至切牙孔完全裂开，并斜向外侧直抵牙槽突，与牙槽裂相连;健侧裂隙缘与鼻中隔相连;牙槽突裂有时裂隙消失仅存裂缝，有时裂隙很宽;常伴发同侧唇裂。

(4)双侧完全性腭裂：常与双侧唇裂同时发生，裂隙在前颌骨部分，各向两侧斜裂，直达牙槽突;鼻中隔、前颌突及前唇部分孤立于中央。