不论选用哪一种抗甲状腺药物治疗甲亢（他巴唑、赛治伙食丙基硫氧嘧啶），在极少数病人中，用药后可能有药物引起的副反应（不良反应）出现，这些反应，有的很轻，有的比较严重，通常见到副反应比较低。

虽然，病人用药以后发生不良反应的概率并不高，但是一旦出现不良反应，病人会感到不舒服可能会影响继续治疗。另外，轻的副反应可能进一步发展为严重 的不良反应，这点是应当重视的。常见的轻反应有皮肤发痒，或有皮疹，同时有不同程度的发痒，疹子的形状多半如同小米粒一样，也可能像“饭疙瘩”一样的荨麻疹。遇有这些情况，不要害怕，但应尽早去医院，找医生诊治。

一般地说，绝大多数服药后出现的轻反应，可以自然好转，常不需要停止用药，大多数人经过医生处理后完全恢复正常。但是如果严重的就需要跟医生沟通，是否调整为其他的内科药物治疗。